近期小编将为大家讲解代谢组学相关知识,包括代谢组学简介,代谢组学分类和应用,代谢组学的实验流程及数据分析,代谢组学的技术手段,代谢组学实验如何来设计,代谢组学样本采集指南,高分代谢组文章解析等,每天只需5分钟,轻松学习代谢组学相关知识~
话不多说,进入今天的专题:代谢组学研究案例解析——大样本代谢组学研究揭示冠心病临床分型及早期诊断标志物。
文章信息文章题目:冠心病的全面代谢组表征
ComprehensiveMetabolomicCharacterizationofCoronaryArteryDiseases
发表期刊:JournaloftheAmericanCollegeofCardiology
影响因子:19.
发表单位:中国药科大学、南京医科大学、医院等
研究手段:LC-MS,内部验证+外部验证
研究背景冠心病(CoronaryArteryDiseases,CAD)被称为人类健康的第一杀手,在中国其发病率和死亡率呈逐年上升并年轻化的趋势。早期干预是治疗冠心病的重要手段,而早期干预的前提是早期诊断。本研究旨在基于大样本冠心病代谢组学研究,发现生物标志物并研究扰动通路,深入理解冠心病发生发展的分子机制,最终助力临床转化,为冠心病的早期诊断及分型提供新依据。
研究方法对来自4个独立中心2,例疑似冠心病(均经冠脉造影金标准验证)血浆样本,按照不同临床阶段分为5组进行对比研究:冠脉正常(NCA)、冠脉硬化症(NOCA)、稳定型心绞痛(SA)、不稳定型心绞痛(UA)、心肌梗死(AMI),采用液相色谱质谱技术(LC-MS)进行非靶向代谢组鉴定并进行多元变量统计分析。
代谢组学研究分为两个阶段:第一阶段生物标志物发现,设计了12个交叉对比组深入比较不同分型的代谢扰动,寻找并鉴定生物标志物;第二阶段生物标志物验证,通过内部诊断准确率、外部多中心预测准确率的综合验证,评估生物标志物的临床诊断意义(见图1)。
图1代谢组研究方案
研究发现1.生物标志物的发现及鉴定
研究人员采用LC-MS技术对血浆样本进行高通量、高覆盖代谢组学数据采集,同时结合生物信息学进行数据挖掘。
从近个代谢物中,发现、鉴定了与冠心病发生发展表型特征密切相关的差异代谢物共89个,扰动的代谢通路主要包括磷脂(溶血磷脂酰胆碱和溶血脂酰乙醇胺)代谢降低、多不饱和游离脂肪酸升高、氨基酸代谢升高、肉碱代谢升高、胆汁酸代谢减弱等(见图2)。
图2冠心病不同临床分型的差异代谢物及关联网络
2.生物标志物验证及临床诊断价值的评估
基于鉴定的差异代谢物,进一步筛选出12组灵敏度高、特异性强的代谢标志物组,用于临床冠心病的快速诊断及不同分型的区分诊断。这些代谢标志物组在发现阶段的AUC值为0.至0.(n=1,),在验证阶段预测准确率为89.2%到96%(n=),在3个外部中心预测准确率为85.3%到96.4%(n=)(见图3)。
图3生物标记物临床诊断价值的评估
研究结论研究基于4个中心、超过例血浆样本队列的高通量、高覆盖代谢组学研究,首次绘制了冠心病不同临床分型的代谢特征谱,发现并鉴定了89个差异代谢产物,可有效预测冠心病的疾病进程,进而为早期诊断提供新的依据。
参考文献FanY,LiY,ChenY,LiP,QiLWetal,ComprehensiveMetabolomicCharacterizationofCoronaryArteryDiseases.JournaloftheAmericanCollegeofCardiology,,68,-.
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