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苏格兰折耳猫的祖先是农场猫。它继承了祖先的勤劳劳动，对环境有很强的适应能力，对疾病也有抵抗力。但是，由于生长基因的改变和体内的遗传问题，苏格兰折耳猫会发生遗传性疾病。
一、身体虚弱：
父母的身体比较娇嫩，所以折耳猫的下一代由于受遗传的影响会很弱。病猫的体型和体重仅为正常猫的2/3，而且由于抵抗力较弱，更易患猫瘟、皮肤病、过敏等后天性疾病。
二、呼吸系统问题：
由于骨骼疾病基因的影响，除了会影响手脚的骨骼，也会影响猫身体其他部位软骨的发育。最常见的是气道狭窄，引起呼吸困难。严重的情况下，需要手术扩大气道。也可能会流鼻血，但原因不明，也没有办法有效治疗。
三、心脏病：
肥厚型心肌病在折猫中也很常见，但通常在疾病危及生命之前很难发现，而且猫需要饮食和终身服药。心脏病对折耳猫的影响是很严重的，稍有不慎，就可能威胁到苏格兰折耳犬的生命。
四、骨遗传病：
1.关节肿胀，指甲生长异常。
2.后肢过短，有不寻常的弯曲、增长或肿块。
3.尾巴粗、短、硬，不弯曲。有些病猫不摇尾巴。
4.后脚异常肥大，如果仔细观察，当猫坐起来时，后脚的垫肉不触地。
苏格兰折耳猫的一些遗传疾病没有有效治疗方法。因此，为了减少遗传病对折猫的伤害，在繁殖时要进行严格的筛选和检查，使刚出生的苏格兰折猫拥有强健的体魄，能够长成美丽迷人的猫。
